| 党政管理机构 | |||
| 党政办公室 | 组织部（党校、巡察工作办公室） | 宣传部 | 统战部（台港澳事务办公室） |
| 纪委（监察专员办公室）机关 | 人事处（人才工作办公室、教师工作部） | 教务处 | 学生工作处（武装部） |
| 研究生处 | 科技处 | 发展规划与学科建设处 | 社会合作处 |
| 财务处 | 审计处 | 资产管理处 | 网络信息管理处 |
| 国际合作交流处 | 保卫处 | 后勤保障处 | 离退休工作处 |
| 莱阳校区管理办公室 | 蓝谷校区管理办公室 | 平度校区管理办公室 | 工会（妇委会） |
| 团委 | 机关党委 | ||
| 教辅机构 | ||
| 图书馆 | 档案馆 | |
| 实验室管理中心 | 现代农业科技服务中心 | |
| 学报编辑部 | ||
| 科研机构 | ||
| 新农村发展研究院（乡村振兴研究院） | 特种食品研究院 | |
| 黄河三角洲盐碱地农业研究院 | 智慧农业研究院 | |
| 农业传播与教育研究院（齐民书院） | ||
| 其他机构 | ||
| 党政办公室： | 政策研究室、法律事务办公室、校友工作办公室、教育发展基金会办公室 | |
| 宣传部： | 新闻中心 | |
| 科技处： | 服务青岛办公室、服务地方办公室、蓝黄办公室 | |
| 实验室管理中心： | 中心实验室 | |
| 新农村发展研究院： | 实施乡村振兴工作领导小组办公室、青岛市乡村振兴研究院 | |
| 研究机构 | |||
| 中国农村发展研究院 | 山东省旱作农业技术重点实验室 | 山东省应用真菌重点实验室 | |
| 齐民书院 | 国家牧草产业技术体系青岛综合试验站 - 经济草本植物应用研究所 | ||
| 国际合作经济发展研究中心 | 青岛市现代农业质量与安全工程重点实验室 - 现代果树产业网 | ||
| 山东省高校植物生物技术重点实验室 | |||
| 动物基因工程与种质创新研究所 | |||
| 生殖诸侯ok1133新线路院 | |||
| 农用生物药创制技术国家地方联合工程实验室 | |||
